Az egyesület megalapításához vezető eseménysort 2019 kora őszén az Egészségügyi Világszervezet (WHO) Európai Irodájának támogatási felajánlása indította. Akkoriban a minisztérium Népegészségügyi főosztályát vezető Vitrai József – hivatkozva a WHO Health 2020 Európai Egészségpolitikai Keretterv dokumentumra – felvetette, hogy a támogatást egy, a gyermekek egészségének javítását célul kitűző Partneri Együttműködés (PE; angolul Coalition of Partners) létrehozására és működtetésére lehessen felhasználni. A WHO és a minisztérium közösen 2019 szeptemberének végén megrendezett workshopján a résztvevők megalakították a gyermekek egészségét fejlesztő PE-t. 

Az alapítók többsége az IT tagjai voltak, és hozzájuk csatlakozott néhány további neves népegészségügyi szakember. Az alapító 11 szakember a következő volt: Bíró Éva, Csizmadia Péter, Girán János, Kaposvári Csilla, Kiss István Zoltán, Kollányi Zsófia, Kőrösiné Horváth Edina, Pipicz Márton, Sándor János, Vitrai József, Várfalvi Marianna. Az alapító okirat így kezdődik: „Meggyőződésünk, hogy a teljes és boldog élet elsődleges feltétele az egészség, amelynek eléréséhez korszerű és hatékony népegészségügy nélkülözhetetlen. A jelentős hazai egészségveszteségek, annak társadalmi-területi egyenlőtlenségei arra hívják fel a figyelmet, hogy a népegészségügyi problémák kezeléséhez mindezidáig alkalmazott megoldási módok nem működtek eredményesen és hatékonyan Magyarországon. Ezért egyesületünk célja a hazai népegészségügy elméletének és gyakorlatának új megközelítéssel történő fejlesztése.”